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A cosa serve NCBI BLAST?
Il Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) trova regioni di somiglianza locale tra sequenze proteiche o nucleotidiche. Il programma confronta sequenze di nucleotidi o proteine con sequenze in un database e calcola la significatività statistica delle corrispondenze.
NCBI BLAST è un software??
Nel 1990, i ricercatori del National Center for Biotechnology Information (NCBI) hanno rilasciato un nuovo pacchetto software per il confronto rapido di sequenze di DNA e proteine [15].
Come trovi il BLAST?
Ricerca per somiglianza di sequenze BLAST
- Seleziona la scheda "Blast" della barra degli strumenti nella parte superiore della pagina per eseguire una ricerca per somiglianza di sequenza con il programma Blast.
- Immettere una sequenza proteica o nucleotidica o un identificatore UniProt nel campo del modulo (Figura 37).
- Fare clic sul pulsante "Esegui Blast".
Cos'è NCBI GenBank?
GenBank® è un database completo che contiene sequenze nucleotidiche pubblicamente disponibili per più di 300.000 organismi denominati a livello di genere o meno, ottenuti principalmente attraverso invii da singoli laboratori e invii di lotti da progetti di sequenziamento su larga scala, compreso il fucile da caccia dell'intero genoma ( ...
